土木工程系
 
系主任：张晋元

系副主任：朱海涛（常务）、雷华阳、芦燕、程雪松

联系电话：022-27400843

水利水电工程系
 
系主任：刘东海 

系副主任：王海军、崔溦、马超 

联系电话：022-27409819

港口工程系
 
系主任：张金凤

系副主任：及春宁、许栋、张浦阳
 
联系电话：022-85356762

船舶与海洋装备智能设计及工程管理系 

系主任：余建星
 
系副主任：罗延生、骆寒冰、徐万海 

联系电话：022-27891968 

海洋工程与智能海事系 

系主任：黄焱

系副主任：李英、余杨
 
联系电话：022-27401519

岩土工程研究所

所长：刘润 

副所长：朱济祥、赵高峰、陈广思

联系电话：022-27404207